Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms