Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPECC1LQ69YQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms