Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD4Q5VX71 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms