Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf135Q5VTT2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms