Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF20Q5VT98 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF20Q5VT98 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms