Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms