Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BEND3Q5T5X7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms