Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD1Q5SYB0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD1Q5SYB0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms