Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C10orf55Q5SWW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms