Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PERM1Q5SV97 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PERM1Q5SV97 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms