Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHYHD1Q5SRE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms