Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A3Q5K4L6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms