Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITRM1Q5JRX3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITRM1Q5JRX3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms