Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERC4Q5GLZ8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms