Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q56UQ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q56UQ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q56UQ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q56UQ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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