Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC2HC1CQ53FD0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC2HC1CQ53FD0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms