Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01559Q495D7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms