Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FHOD3Q2V2M9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FHOD3Q2V2M9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms