Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TYSND1Q2T9J0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TYSND1Q2T9J0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms