Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPEL1Q2QD12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms