Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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