Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HADHQ16836 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HADHQ16836 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms