Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME3Q16798 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ME3Q16798 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME3Q16798 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME3Q16798 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME3Q16798 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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