Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
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FOXD1Q16676 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
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FOXD1Q16676 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FOXD1Q16676 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
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