Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL15Q16663 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL15Q16663 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms