Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX1AQ16623 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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