Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDB1Q16531 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDB1Q16531 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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