Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX1Q16384 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SSX1Q16384 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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