Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CST6Q15828 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST6Q15828 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CST6Q15828 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST6Q15828 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST6Q15828 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms