Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNN3Q15417 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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