Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUM3Q15397 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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