Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRKQ15262 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRKQ15262 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
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