Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCOLCEQ15113 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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