Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCF4Q15080 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms