Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCAPHQ15003 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPHQ15003 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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