Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPNMBQ14956 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPNMBQ14956 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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