Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBM39Q14498 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBM39Q14498 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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