Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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TUBA3CQ13748 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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TUBA3CQ13748 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBA3CQ13748 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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