Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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