Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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