Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMED1Q13445 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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