Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B2Q13435 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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