Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MSLNQ13421 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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