Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SP140Q13342 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SP140Q13342 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SP140Q13342 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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SP140Q13342 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SP140Q13342 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SP140Q13342 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SP140Q13342 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SP140Q13342 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP140Q13342 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP140Q13342 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SP140Q13342 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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