Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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