Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRDNQ13061 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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