Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRN3Q13033 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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