Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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FOXC1Q12948 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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