Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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