Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms